Warna mata ialah warna iris, bahagian berwarna yang mengelilingi pupil (bintik hitam kecil di tengah mata). Fakta menarik bahawa setiap orang mempunyai warna mata yang unik, sama seperti cap jari.

Warna mata yang paling biasa ialah coklat, diikuti oleh biru, hijau, atau hazel. Selain itu, iris boleh menjadi warna campuran seperti coklat dengan kuning, coklat dengan hijau, atau coklat dengan biru.
Iris terletak di dalam mata, di bawah lapisan yang jelas dan tidak berwarna dipanggil kornea yang nipis kurang daripada setengah milimeter. Iris mengandungi banyak sel, otot khas, saluran darah dan saraf. Di sekeliling iris adalah bahan berlendir dengan berjuta-juta gentian kecil bersilang antara satu sama lain.
Tubuh manusia hanya menghasilkan pigmen iris coklat (melanin), bukan pigmen iris biru, hijau, atau hazel.
Sel pigmen iris mengandungi melanosom. Semua warna iris mempunyai bilangan sel pigmen yang sama, tetapi butiran pigmen di dalam sel adalah berbeza, contohnya iris coklat mempunyai lebih banyak butiran pigmen daripada iris biru.
Sel-sel iris lain membuat gentian kecil dan lendir dalam iris, yang membantu melindungi iris daripada kerosakan. Murid boleh mengecut atau melebar terima kasih kepada otot khas iris dengan gentian elastik.
Bahagian belakang iris adalah permukaan gelap dengan sel-sel yang dipenuhi dengan Pigmen Permukaan Posterior yang membantu menghalang cahaya daripada bertaburan melalui iris, yang baik untuk penglihatan.
Cahaya putih mengandungi spektrum warna pelangi dari biru hingga merah. Apabila cahaya melalui iris, cahaya biru menyebar lebih banyak daripada warna lain dan dipantulkan kembali. Kemudian, jika terdapat lebih sedikit butiran pigmen, kita akan melihat iris itu sebagai biru.
Warna lain dalam cahaya, terutamanya merah, kurang bertaburan dan memasuki iris antara gentian, lendir, dan sel. Jadi mata hijau, hazel atau coklat mempunyai lebih banyak pigmen yang menyerap cahaya ini.
Oleh itu, ia adalah hasil daripada beberapa warna yang menyerakkan lebih atau kurang cahaya daripada yang lain digabungkan dengan zarah pigmen coklat yang menyerap lebih banyak warna dan bilangan zarah pigmen yang menentukan warna mata seseorang.

Warna iris tidak kekal sama sepanjang hayat tetapi boleh berubah disebabkan oleh pigmen gelap yang dihasilkan dalam sel iris selepas kelahiran. Sebagai contoh, bayi yang baru lahir dengan mata biru mungkin bertukar coklat atau hazel dalam masa 1 hari sahaja.
Penyakit atau kecederaan tertentu juga boleh menyebabkan warna iris berubah.
Sesetengah orang dilahirkan dengan satu mata coklat dan satu mata biru, dan ini tidak pernah berubah sepanjang hayat mereka. Punca perkara ini masih tidak diketahui.